Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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