Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm29609Q3UU56 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm29609Q3UU56 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm29609Q3UU56 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm29609Q3UU56 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm29609Q3UU56 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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