Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm6899Q3USS0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm6899Q3USS0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms