Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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