Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Parp8Q3UD82 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms