Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf149Q3U2C5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms