Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hace1Q3U0D9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms