Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp1aQ2LKU9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms