Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms