Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms