Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc2Q05020 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms