Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nf1Q04690 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nf1Q04690 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms