Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms