Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp4Q00724 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms