Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx3P81067 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms