Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Irx2P81066 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms