Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd13P70217 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms