Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vamp3P63024 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vamp3P63024 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms