Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsnl1P62761 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms