Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Dpf3P58269 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dpf3P58269 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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