Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sh3bp1P55194 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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