Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcanP55066 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
NcanP55066 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcanP55066 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcanP55066 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcanP55066 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcanP55066 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcanP55066 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcanP55066 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NcanP55066 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcanP55066 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcanP55066 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NcanP55066 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcanP55066 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcanP55066 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcanP55066 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcanP55066 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NcanP55066 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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