Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SrprbP47758 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SrprbP47758 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrprbP47758 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrprbP47758 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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SrprbP47758 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SrprbP47758 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SrprbP47758 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SrprbP47758 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SrprbP47758 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SrprbP47758 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SrprbP47758 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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