Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms