Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtbP41155 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LtbP41155 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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LtbP41155 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtbP41155 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
LtbP41155 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LtbP41155 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms