Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VhlP40338 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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