Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Stfa1P35175 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Stfa1P35175 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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