Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms