Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pou5f1P20263 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms