Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18529 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18529 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P18529 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
P18529 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms