Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18525 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18525 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18525 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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P18525 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18525 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18525 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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