Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxb1P17919 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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