Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nr4a1P12813 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms