Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DmdP11531 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DmdP11531 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
DmdP11531 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
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DmdP11531 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DmdP11531 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DmdP11531 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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DmdP11531 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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DmdP11531 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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DmdP11531 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DmdP11531 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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