Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccl2P10148 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccl2P10148 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccl2P10148 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccl2P10148 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl2P10148 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl2P10148 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl2P10148 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl2P10148 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl2P10148 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms