Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tgfb1P04202 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tgfb1P04202 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tgfb1P04202 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tgfb1P04202 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms