Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab33bO35963 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab33bO35963 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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