Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cited2O35740 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms