Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SdcbpO08992 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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