Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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