Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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