Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Gm20795J3QP49 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Gm20795J3QP49 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Gm20795J3QP49 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm20795J3QP49 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm20795J3QP49 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Gm20795J3QP49 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20795J3QP49 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20795J3QP49 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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