Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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