Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Taf4bG5E8Z2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Taf4bG5E8Z2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Taf4bG5E8Z2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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