Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vmn1r167G3UW71 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vmn1r167G3UW71 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms