Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm10477F6SW83 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm10477F6SW83 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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