Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vmn1r68E9Q0V3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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