Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms