Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms