Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf217D3YYI7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rnf217D3YYI7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rnf217D3YYI7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rnf217D3YYI7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rnf217D3YYI7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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